注射疫苗后不产生抗体的原因比较复杂，大概有以下几种情况：

◆检测方法不精确
　　
实际已产生抗体，但因检测方法不精确而致结果阴性。应当用最灵敏的方法，如酶联免疫法或放射免疫法重新检测。检测方法不先进或不灵敏会得出假阴性结果。

◆免疫反应太弱
　　
机体对疫苗的免疫反应太弱，只产生微量的抗体，即使用先进的检测方法也不能测出。这时可加大乙肝疫苗的剂量，每月注射1次，共3次。并可同时合用其他免疫刺激药物，以提高免疫效果。

◆已发生隐匿性感染
　　
有少数病人实际上已感染了乙肝病毒，但其乙肝表面抗原的产量很少，用现有的检测方法查不出来，或者乙肝病毒已经发生变异，与普通试剂不发生反应，另外还可能有其他原因。这些人虽然已感染了乙肝病毒，但机体呈免疫耐受状态，不产生免疫反应而，在这种情况下，再注射乙肝疫苗，也不会产生表面抗体。

◆免疫功能低下、免疫缺陷者　
　　
有类似情况的人不易产生抗体，如晚期肾病、器官移植后、艾滋病感染者等。

◆乙肝病毒容易发生变异，变异后的病毒，其生物特性有了新的变化，可使乙肝疫苗无法发挥作用。另外，一些乙肝病毒感染者，乙肝病毒表面抗原的亚型有所不同。亚型种类有多种，乙肝疫苗是针对主要的病毒亚型而设，所以难免有顾及不到的亚型，如果是较为罕见的病毒亚型，乙肝疫苗也不会有保护作用。